引起输卵管妊娠的原因分为多种，最常见的原因是由盆腔炎导致，发生炎性改变导致受精卵不能够顺利的进入宫腔着床，会在输卵管部位着床。或者是由于女性做人工流产手术之后引起上行的感染，月经期间不注意卫生，月经期间同房都会引发妇科炎症。

　　或者是导致子宫内膜异位，也会影响到怀孕的过程，会引起输卵管妊娠。或者是由于有女性生殖系统畸形，也会引起输卵管妊娠。如果有激素水平的改变，内分泌功能紊乱导致输卵管蠕动减慢，受精卵不能够达到宫腔内着床，而在输卵管部位妊娠。