如果得了先天性肛门直肠畸形，可以通过一些中药进行调理，口服凉血地黄汤，起到清热利湿的作用，应用麻仁丸起到润肠通便的作用。

　　对于轻度狭窄的患者可以采用手指或扩肛器扩肛治疗，平时应当保持肛周清洁，经常用中药坐浴或熏洗，常用的药物有五倍子汤、苦参汤或止痛如神汤。如果肛门直肠畸形患者或有细小瘘孔，位置比较低，应当在出生后立即手术。对于有大瘘孔，排便无明显障碍的患者，先行保守疗法，待患儿6个月以后，再考虑手术治疗。