法洛氏四联症是先天性心脏病中最常见的紫绀型先心病，大部分的孩子手术效果非常好，术后不会有明显的并发症。但是，也会有少部分出现并发症的情况，最常见的并发症有室间隔缺损的残余分流、三度房室传导阻滞，需要安装永久性的起搏器，主动脉瓣损伤造成主动脉瓣的反流需要再次手术，右室流出道疏通后有残留的压差，孩子有可能也会接受第二次的手术。

　　而严重复杂的法洛氏四联症需要涉及到主动脉瓣环跨环补片，没有很好的主动脉瓣。所以，动脉瓣会造成严重的反流，在孩子出生后2~4年可能会引起心衰的程度。