骨嗜酸性肉芽肿的治疗方法包括非手术治疗以及手术治疗，如果侵犯椎体及骨干时，部分单发的病灶也具有自愈的倾向，明显的压缩性骨折也可以在原位愈合，甚至不影响其高度。

　　对于较小的病灶也可以给予泼尼松，给予病灶内注射，包括确诊、复发以及继发的病灶，注射效果均较理想。

　　对于一部分需要手术治疗的患者，可以给予病灶刮除后植骨，并且极少复发。对于侵犯如肋骨、腓骨这样的一个非功能部位的骨骼，也可以给予骨骼的病变、病灶截除术。对于脊柱、椎体手术宜切除的情况，也可以行放射治疗或术后辅助放射治疗。