很多人以为只要做好卵巢囊肿切除手术以后，囊肿的问题就能够完全治愈好，但实际上并不是将囊肿组织切除以后卵巢囊肿就能够一了百了彻底治疗好的。实际上卵巢囊肿在临床上复发率是非常高的，如果患者在术后不注意做好相关的护理措施，并且在术后规定的时间内不按时吃药，不定期做好复检就有可能会导致卵巢囊肿复发。
巧克力囊肿，患者在手术之后若不坚持用药半年，其复发率超过50%，如果坚持用药半年，其复发率相当可以控制减少些。而有些卵巢囊肿，如畸胎瘤，一旦手术摘除之后，则不需要吃药，也不存在复发的可能。
但有的卵巢囊肿原来只发病于一侧，但是可能进行一侧卵巢囊肿切除以后，可能在另外一侧出现了卵巢囊肿的症状，另外也有可能会出现本身患者是双侧卵巢囊肿，但检查的时候却只检查出了一侧，因此在治疗的时候也只当做是一侧卵巢囊肿来治疗，因此在术后进行复检的时候又发现了另一侧的疾病症状表现，又需要进行一次手术。因此，并不是说一旦做了卵巢囊肿切除术就可以掉以轻心了，对于需要服用药物的情况，一定得遵从医嘱。此外，妇女每年应该定期进行妇科检查，以便尽早疾病的蛛丝马迹。