口腔疱疹包括口腔单纯性疱疹、口腔带状疱疹、手足口病。口腔单纯性疱疹是由单纯性疱疹病毒引起，对人体的感染非常多见，口腔、皮肤、眼、会阴、神经系统等是常易受侵犯的部位。人类是其天然宿主。又可分为原发性疱疹性口炎和复发性疱疹性口炎，原发性疱疹性口炎多见于儿童，复发性疱疹性口炎多见于成人，主要表现为唇疱疹。口腔带状疱疹是由水痘-带状疱疹病毒引起的急性感染性疾病。手足口病是由肠道病毒引起的传染病，引发手足口病的肠道病毒有20多种（型），其中以柯萨奇病毒A16型（CoxA16）和肠道病毒71型（EV71）最为常见。多发生于3岁以下儿童。
1.单纯性疱疹
本病是由DNA病毒的单纯疱疹病毒（HSV）所致。人类单纯疱疹病毒分为两型，即单纯疱疹病毒Ⅰ型（HSV-Ⅰ）和单纯疱疹病毒Ⅱ型（HSV-Ⅱ）。过去认为HSV-1主要导致腰以上的皮肤黏膜病损，HSV-2主要累及腰一下部位，但目前很多研究表明在口腔单纯疱疹感染中，甚至健康人群的口腔中分离到HSV-2病毒，这可能与生活方式的变异有关。
2.带状疱疹
带状疱疹的病原属脱氧核糖核酸疱疹病毒，与水痘病毒一致，又称水痘-带状疱疹病毒（VZV），为嗜神经病毒。
3.手足口病
引起手足口病的肠道病毒包括肠道病毒型（EV）和A组柯萨奇病毒（CoxA）埃可病毒（Echo）的某些血清型EV感染引起重症病例的比例较大。