白塞氏是自身免疫性疾病，自愈的可能性不大，急性活动期，应卧床休息。
发作间歇期应注意预防复发。如控制口、咽部感染、避免进刺激性食物。伴感染者可行相应的治疗。大部分预后良好，但有眼病者，其视力可严重下降，甚至失明。
近年来，经早期积极治疗眼炎，并采取预防措施，使失明率有所下降。中药只是调理作用，西药主要是靠激素来调节自身免疫。
长时间用激素对身体有害的，这会导致出现激素面容，引起向心性肥胖，身体抵抗力降低。所以主要是在病情的急性期才需要用激素，病情缓解后可以逐渐减量，应用一些免疫抑制剂，比如秋水仙碱，甲氨蝶呤等。